Det er spesielle metabolske veier som kan defineres for å identifisere konstruksjonen av spesifikke molekyler.
Scichimic acid pathway: sekundær metabolsk vei som har scichiminsyre som forløper, et molekyl som inneholder de strukturelle og kjemiske egenskapene som finnes i de sekundære metabolittene som stammer fra den.
Skikiminsyremolekylet består av: en 6-leddet ring, 1 karboksylgruppe og 3 hydroksylgrupper. Den samme molekylære arkitekturen finnes i de sekundære metabolittene som stammer fra den, og som faktisk kalles derivater av syren. scichimic. Scichiminsyre stammer fra foreningen av to mellomprodukter av to forskjellige primære metabolske veier:
erytrosium-4-fosfat (3C): mellomprodukt i den mørke fasen av fotosyntese, anabol metabolsk prosess;
fosfoenolpyruvinsyre (3C): mellomprodukt av glykolyse, katabol metabolsk prosess;
Derfor erythrosium-4-fosfat + fosfoenolpyruvinsyre = scichiminsyre: første forløper for sekundære metabolske veier.
Cellen syntetiserer scichiminsyren når behovene er slik at de tillater det, eller når mengdene til de to primære mellomproduktene er så mange og slik at de kan akkumuleres; dette skjer når det er tilstrekkelig mengde ATP i cellen og dette bremser reaksjonene ved primær katabolisme og anabolisme.
Banen for malonsyre og mevalonsyre: begge forløperne stammer fra et molekyl av Acetyl CoA, derfor ligger begge til grunn for en enkelt bane: acetatveien. Acetyl CoA er et forbindelsesmolekyl mellom glykolyse og Krebs syklus, og vi kan derfor definere det som et mellomprodukt av primær metabolisme av cellen.
Acetatgruppe (gruppe med to karbonatomer) + CoA (koenzym A) = Acetyl CoA: molekyl som tilhører den primære metabolismen, som brukes som en biologisk byggestein i konstruksjonen av sekundære metabolitter.
Acetatveien kjennetegnes deretter ved malonsyreveien og mevalonsyrebanen.Koenzym A fungerer som en transport av de to karbonholdige enhetene fra cytoplasma til mitokondrien i cellen, der Krebs -syklusen finner sted.kull transporteres i stedet andre steder i tilfelle av energioverskudd og kan gå til å utgjøre de mest varierte sekundære metabolitter; disse har et jevnt antall karbonatomer som felles egenskap, inkludert malonsyre (C4) og mevalonisk (C6).
De metabolske veiene til scichiminsyre og acetat har derfor en presis molekylær arkitektur, som lar oss enkelt identifisere deres sekundære derivater. Til de alkaloider, som har diversifiserte arkitekturer, er identifiseringen av forløperen ikke så lett; med andre ord er det ikke så lett å klassifisere de enkelte kategoriene alkaloider, og spore hver enkelt til en enkelt forløper. Alkaloider har faktisk mer enn en forløper, siden de stammer fra aminosyrer (primære nitrogenforbindelser, som cellen bruker til å produsere sekundære nitrogenmolekyler). De sekundære nitrogenmetabolittene er hovedsakelig alkaloider, men det er også andre molekyler med en lavere helseprofil enn sine egne, for eksempel cyanogene glykosider (inneholdt i bitre mandler) og β-cyanos (pigmenter) Aminosyrer er nitrogenholdige forbindelser som er diversifisert fra hverandre, og dette mangfoldet gjenspeiler diversifiseringen av deres direkte derivater, som er alkaloidene.
Det eneste kjemiske elementet som forener de forskjellige kategoriene av alkaloider er et nitrogenatom innelukket i en heterocyklisk ring, eller i det minste et nitrogenatom med en fri elektrondublett som gir dem grunnleggende egenskaper; den samme grunnleggende reaktiviteten som gjør at vi kan trekke ut de enkelte alkaloidene ved forskyvning.
Vi kan oppsummere det ved å si det karbohydratveien er den metabolske banen som ligger til grunn for syntesen av alle sekundære metabolitterDerfor inkluderer den alle de metabolske veiene som er sett tidligere:
- acetat er produktet av fullstendig riving av glukosemolekylet;
- aminosyrer stammer fra metabolske prosesser for nedbrytning av karbohydrater;
- scichiminsyre er en forløper for sekundære metabolitter, men også for aromatiske aminosyrer (fenylalanin, tryptofan og tyrosin);
-glykosidet er en sekundær metabolitt sammensatt av et sukker pluss en ikke-sukker enhet, kalt aglykon, som antagelig stammer fra en av de metabolske veiene som er oppsummert.
Alle de biogenetiske byggesteinene som sekundære metabolitter stammer fra, stammer enten fra katabolismen av karbohydrater eller fra deres anabolisme. Disse sukkerene er de samme sukkerenhetene som en gang var knyttet til aglykonen, utgjør glykosidene.
Den metabolske banen til acetat er delt inn i et tett biogenetisk tre, som inneholder alle navnene på de sekundære metabolittene som det gir opphav til. Forskjellige, avhengig av cellens behov:
- Krebs syklus med sluttproduksjon av ATP (primærmetabolisme);
- β-oksidasjon og syntese av fettsyrer (primær metabolisme);
- Syntese av malonat eller malonsyre (4C), som stammer fra foreningen av to acetatmolekyler, og av mevalonat eller mevalonsyre (6C) som stammer fra foreningen av tre acetatmolekyler. Cellen bruker disse to molekylene med et jevnt antall karbonatomer for å bygge forskjellige molekylære kategorier, bestående av lineære kjeder av hydrokarbonenheter, for eksempel: fettsyrer - som igjen brukes til å produsere glyserider og vokser - terpenoider, antrakinoner og steroider.
Andre artikler om "Biogenese og egenskaper ved de aktive ingrediensene"
- Primær metabolisme og sekundær metabolisme av en plante
- Farmakognosi
- Metabolsk vei til scichiminsyre