Β-oksidasjonen er settet av prosesser som finner sted på karbonet i Β til karbonylet.
Det første enzymet i prosessen er "acylkoenzym A dehydrogenase som finnes på den indre mitokondriemembranen og har FAD som en kofaktor som reduseres til FADH2 og gir sin reduserende kraft til koenzym Q (respirasjonskjede); dette enzymet katalyserer reaksjonen som fra et acylkoenzym A, fører til dannelse av enoylkoenzym A (mer presist trans 2,3 enoylkoenzym A) som er et umettet α-Β system (alken). Det andre enzymet av b-oksidasjon er den "enoyl -koenzym A hydratase som omdanner enoyl til L-Β hydroksy acyl koenzym A; dette enzymet er absolutt stereospesifikt for L-Β hydroksy acyl koenzym A isomeren.
Den påfølgende reaksjonen katalyseres av L-Β hydroksyacyl-koenzym A-dehydrogenase (NAD-avhengig enzym) som omdanner L-Β hydroksyacyl-koenzym A til b-ketoacyl-koenzym A; samtidig skjer reduksjonen av NAD + til NADH.
Til slutt griper en inn tiolase (b-ketoacyl-koenzym A-tiolase); reaksjonen krever også et lytisk middel representert ved koenzym A: et fragment med to karbonatomer dannes (dvs. "acetylkoenzym A) og det gjenværende karbonholdige skjelettet representerer et acylkoenzym A (sammenlignet med det første har det mistet to atomer karbon ).
Acylkoenzym A oppnådd med Β-oksidasjon, gjentar prosessen til det bare oppnås acetylkoenzym A.
Nesten absolutt regel: når dehydrogenering skjer mellom to tilstøtende atomer med en klar forskjell i elektronaffinitet, er kofaktoren til enzymet dehydrogenase nesten alltid NAD, mens hvis dehydrogeneringen skjer mellom to tilstøtende atomer inkludert c "er det liten forskjell på elektronaffinitet , kofaktoren er FAD.